SIM output with parameters: M = 1, I = -1, V = -1 O = 6, E = 0.2 Upper Sequence : tob.38-44 Length : 6000 Lower Sequence : liv.42-48 Length : 6000 ********************************************************* Number 1 Local Alignment Similarity Score : 3265.4 Match Percentage : 76% Number of Matches : 4411 Number of Mismatches : 950 Total Length of Gaps : 378 Begins at (2, 6) and Ends at (5711, 5395) 0 . : . : . : . : . : 2 TATATATCATATATGTGGGTACATATTGTGTATCAAGAACAAAAAAATGC ||||||| ||||| ||-------------------| ||: | | |:|| 6 TATATATAATATAAGT ATAATTTATATACGC 50 . : . : . : . : . : 52 GGATATGGTCGAATGGTAAAATTTCTCTTTGCCAAGGAGAAGATGCGGGT ||:|||:||: ||||||||||||:|||:||||||||||||| |||||||| 37 GGGTATAGTTTAATGGTAAAATTCCTCCTTGCCAAGGAGAATATGCGGGT 100 . : . : . : . : . : 102 TCGATTCCCGCTATCCGCCCAAGATCCAAGATAAAGTAATTTTATTACTA |||||||||||||:|||||------------------------------- 87 TCGATTCCCGCTACCCGCC 150 . : . : . : . : . : 152 TTTATTTATTATTTAATTTCATAAATAGCATTAAATATATCCTTAAATTA -----------------------||| | | ||| || ---|||||| | 106 AATTGAAATAATTAG CTTAAAAAA 200 . : . : . : . : . : 202 AGGATTTGGTATAGTTGGCCGTGATAGTGTAGTGATTCTATCCCTCCCCT ||:|---------------------------------------------- 130 AGAA 250 . : . : . : . : . : 252 ACGTTTTCTTTTTCCTTCCACCCCCAAAAAGCGAAAGGCGGGAATTAATT ----------------------------------------------||| 134 AATA 300 . : . : . : . : . : 302 ACTAGTTAACAGAGTCAACCCTAAAATAGTTTGGCAAAACAAGATGTTGC | ||------------------|||||| ||| ----------| | || 138 AGTA AAAATATTTTTT TTTGGC 350 . : . : . : . : . : 352 GGAGACAGGATTTGAACCCGTGACCTCAAGGTTATGAGCCTTGCGAGCTA ||||||||||||||||||::|||||||||||||||||||||||||||||| 160 GGAGACAGGATTTGAACCTATGACCTCAAGGTTATGAGCCTTGCGAGCTA 400 . : . : . : . : . : 402 CCAAACTGCTCTACCCCGCGCCGAAGATAAGAACTGAAAACTAATAGATA |||:||||||||||:|||||::: |: ||| :| :||: || | ||| 210 CCAGACTGCTCTACTCCGCGTTATAATTAACGAAAAAAGTATACTCTATA 450 . : . : . : . : . : 452 AACAAGGATTAAATGCGCCCCTCCACCCTATCTGTACAAA TAG || | ||| | ||----------------------||||:-------| | 260 AAAATGGAATTAA ACAAGATATTTTTTG 500 . : . : . : . : . : 495 AATAGCCCATTTATACAGAATGGTAAAGGGGCTTCTATGATCATCGACCA ||||:|||-----------------------| :|| | || | |:| : 288 AATAACCC CGCCTCTTATAAGAGGCGG 550 . : . : . : . : . : 545 TAGAAATAGAAATGAAGCGTTAATCCTTACCAACTTGATCTTGTTGCTCC --------|||| :|| | ||| :||||||||| |||:| |||:|||| 315 GAAAGAAACCCAAAATGTTTACCAACTAGATTTGGTTACTCC 600 . : . : . : . : . : 595 TGGCAACAAACATGCATGAACCATTTCACGAAGTATGTGTCCGGATAGTC |||||:||||||||||||:||||||||||||||| :||||::||||: | 357 AGGCAATAAACATGCATGAGCCATTTCACGAAGTAAATGTCTAGATAAAC 650 . : . : . : . : . : 645 CAAAGTCTCGATAGTTAGCTCTCGGCCTTCCGGTCAAAAAACAACGTCGA ||||:|| |||||:|| |||:| ||:|||||:|||||||||||||| ||| 407 CAAAATCGCGATAATTTGCTTTAGGTCTTCCAGTCAAAAAACAACGACGA 700 . : . : . : . : . : 695 TGAAGGCGTGTAGGTGCACTATTCCGTGGTGGGGATTGTAACTTTCCATA |||||:|| || || |||||||| ||||||:::||||||||:|||:: |: 457 TGAAGACGAGTCGGGGCACTATTACGTGGTAAAGATTGTAATTTTTTTTG 750 . : . : . : . : . : 745 AATTTCCCATTTGTCACTCAACGACGGAACCTTGCTTATTTCTTTCTTTG || ||||||||| |||:::||:||:|:::::|: | ||||:|||:|||: 507 AAATTCCCATTTTTCATCTAATGATGAGGTTTCCGTAATTTTTTTTTTTA 800 . : . : . : . : . : 795 AGGATCGACGAATCGAATGATATTTCTGTTCCAATTTTTGCCTCTTCTTC |:|| : ||| | : | :|||||:| |||:|| |||||:||:||:||: 557 AAGAATTACGTAAAATTTTGTATTTTTTTTCTAAATTTTGTCTTTTTTTT 850 . : . : . : . : . : 845 TCCCTCTGAATCAAACTTTTCCTTGCCATAATGGTTGAATTCCTA ||:||:||||| |:|||:||::|||||||||| :|| |||| ||----- 607 TCTCTTTGAATAAGACTCTTTTTTGCCATAATTATTTAATTAGTAAGATA 900 . : . : . : . : . : 890 TTAGTATCCATGATACAAGTCGAATCCTAGATGTAGAAA -----------| |:| |::|| | | || : ||:| |:|||| 657 TTCTTTTTCAATAAATTTTTATTAAAAAATATTTTGAGTAAAATTGGAAA 950 . : . : . : . : . : 929 TAGAAGAAGGTGGACCCCCTCTCCGTCGAAAGAAATGAGATTATCGCAGA | ||--------------------------------------------- 707 TTTAA 1000 . : . : . : . : . : 979 TACACACATTAAAAATAT TAACCAAATTTGCCCGACGTAGAGGCAA ---------|| ||||||----|||||||||||:|| ||:|||||:|||| 712 TACAAATATAATTTAACCAAATTTACCAGATGTAGAAGCAA 1050 . : . : . : . : . : 1025 TCAAGAAAGCCGCATAAGTGAATATATAACCTACAGAAAAGTGAGCTAAT |:||:||||| ||||||||:||||||||||||||||||||:||||||||| 753 TTAAAAAAGCAGCATAAGTAAATATATAACCTACAGAAAAATGAGCTAAT 1100 . : . : . : . : . : 1075 CCAACCAATCTTGCTTGTACAATGGAAAGGGCCACTGGTTTATCTCTCCA |||||:||||||||||| |||||:|||||:||:||||||||||||:|||| 803 CCAACTAATCTTGCTTGAACAATAGAAAGAGCTACTGGTTTATCTTTCCA 1150 . : . : . : . : . : 1125 GCGAATCAAATTGGCCAAAGGTGTGCGTTCATGAGCCCATGCTAAAGTTT |||||::||||| ||:||||| ||:|||||:|||||||| |||||||||| 853 GCGAACTAAATTCGCTAAAGGAGTACGTTCGTGAGCCCAAGCTAAAGTTT 1200 . : . : . : . : . : 1175 CAATCAATTCCTGCCAATATCCACGCCAAGAAATTAAGAACATAAATCCA |||| |:|||:||||||||||||||||| || ||:|::|||||||||||| 903 CAATAAGTTCTTGCCAATATCCACGCCACGATATCAGAAACATAAATCCA 1250 . : . : . : . : . : 1225 GTAGCCCAAACAAGATGTCCAAATAAGAACATCCATGCCCAAACCGATAA ||||||||||| |:||| ||||||||:||||||||||||||||| ||:|: 953 GTAGCCCAAACTAAATGACCAAATAAAAACATCCATGCCCAAACAGACAG 1300 . : . : . : . : . : 1275 ACTATTCATACCAAAAGGATTATATCCGTTGATAAGTTGTGAAGAGTTTA |||||||||||||||||||||||||||:||:|| |:|||||||||:|||| 1003 ACTATTCATACCAAAAGGATTATATCCATTAATCAATTGTGAAGAATTTA 1350 . : . : . : . : . : 1325 ACCATAAATAATCCCTTAACCAGCCCATCAAATAAGTGGAAGATTCATTA |||||||||||||:||||||||||||||:||||| ||:|||||||||||| 1053 ACCATAAATAATCTCTTAACCAGCCCATTAAATATGTAGAAGATTCATTA 1400 . : . : . : . : . : 1375 AACTGTGAAACGTTACCCTGCCATAATGTGATGTGCTTCCAATGCCAATA ||:|||| :|:|| ||:|||||||||||:||:||:|||||||||||||| 1103 AATTGTGCTGCATTTCCTTGCCATAATGTAATATGTTTCCAATGCCAATA 1450 . : . : . : . : . : 1425 AAAAGTAACCCATCCAATAGTATTTAACATCCAAAAAACTGCCAAATAAA ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||| 1153 AAAAGTAACCCATCCAATAGTATTTAACATCCAAAAAACTGCTAAATAAA 1500 . : . : . : . : . : 1475 ACGCGTCCCATGCCGAAATATCACAAGTACCGCCTCGTCCTGGGCCATCG | ||:||||| || |||||||||||||||||:|||||||| ||:|||||: 1203 AAGCATCCCAAGCAGAAATATCACAAGTACCACCTCGTCCAGGACCATCA 1550 . : . : . : . : . : 1525 CACGGAAAACTATAACCGAAATCCTTTTTATCTGGCATTAACTTGGAACC || ||||||||||||||:|| ||:|||||||||||||||||:||:|| || 1253 CAAGGAAAACTATAACCAAATTCTTTTTTATCTGGCATTAATTTAGATCC 1600 . : . : . : . : . : 1575 ACGTGCATCTAAAGCACCTTTTACTAAGATCAATGTAGTTGTATGTAAAC ||||||||||||||||||||:|||||:||:|||||||| |||||||||| 1303 TCGTGCATCTAAAGCACCTTTCACTAAAATTAATGTAGTAGTATGTAAAC 1650 . : . : . : . : . : 1625 CAAGAGCAATAGCATGATGAACCAAAAAGTCTCCAGGACCTATTGTTAAA | |:|||||||||:||||| ||:||||||||||||||||| ||||||||: 1353 CTAAAGCAATAGCGTGATGTACTAAAAAGTCTCCAGGACCAATTGTTAAG 1700 . : . : . : . : . : 1675 AATAATGAATTACTATTTTCATTAACAGCATTTAACCAACCCGGCAACCA || |:|||||||||||| |:||| |:|||||:||||||||| ||:||||| 1403 AAAAGTGAATTACTATTATTATTTATAGCATCTAACCAACCAGGTAACCA 1750 . : . : . : . : . : 1725 GATGCTTCGACCCGCATTGAATGCTGGACCACTCGTTGAAGATAAAAGTA ||||||:|||| |||||:|||||||||::|:|:||||| |||||||||| 1453 TATGCTTTGACCAGCATTAAATGCTGGATTATTTGTTGATGATAAAAGTA 1800 . : . : . : . : . : 1775 CATCGAACCCATATGAAGTTTTACCATGAGCGGATTGTATCCATTGAGCA ||||:|| ||||||:|||:||||||||||||:|||||||||||||||||| 1503 CATCAAAACCATATAAAGCTTTACCATGAGCAGATTGTATCCATTGAGCA 1850 . : . : . : . : . : 1825 AATATAGGTTCAATCAAGATTTGCTTCTCCGGAGTGCCAAAGGCAAGCAT || |||||||||||:||:|||||:||:|| |||||:|||||:|||||||| 1553 AAAATAGGTTCAATTAAAATTTGTTTTTCAGGAGTACCAAAAGCAAGCAT 1900 . : . : . : . : . : 1875 GACATCATTATGAACATAAAGTCCCAGGGTATGGAATCCCAGAAAGAGGC :||||||||||||||:||||| ||:|::|||||:|||||:||||| |::| 1603 AACATCATTATGAACGTAAAGACCTAAAGTATGAAATCCTAGAAATAAAC 1950 . : . : . : . : . : 1925 TGGCCCAACTTAAATGAGATATGATAGCTTCTTTATGCTCTAACATTCTT |:||||||||||||||:||||| ||||||||||||||:||||||||||| 1653 TAGCCCAACTTAAATGGGATATTATAGCTTCTTTATGTTCTAACATTCTA 2000 . : . : . : . : . : 1975 GCCAATACATTATCTTCATTTTGCTCCGGATTGTAATCTCTAATGAAAAA ||:|||||||||||||:||||||:||||||||:|||||||||||:||:|| 1703 GCTAATACATTATCTTTATTTTGTTCCGGATTATAATCTCTAATAAAGAA 2050 . : . : . : . : . : 2025 TATAGCTCCATGAGCAAAAGCTCCTGTCATGATGAATCCTGCGATATATT |||||||||||||||||||| ||||||||:||:|| || ||:||||||| 1753 AATAGCTCCATGAGCAAAAGCACCTGTCATAATAAAACCAGCAATATATT 2100 . : . : . : . : . : 2075 GGTGGTGGGTATATAATGCAGCTTGAGTAGTAAAGTCTTGTGCTATGAAT |:||:||:||||||||||||||||| || |||||:|||||||| | :||: 1803 GATGATGAGTATATAATGCAGCTTGCGTTGTAAAATCTTGTGCAAGAAAC 2150 . : . : . : . : . : 2125 GCATAAGCAGGTAAAGAGTACATGTGTTGAGCTACCAAAGAAGTAATAAC |||||:| |||||||||:|||||:|||||||||||:||:||:|||||||| 1853 GCATAGGGAGGTAAAGAATACATATGTTGAGCTACTAAGGAGGTAATAAC 2200 . : . : . : . : . : 2175 CCCTAAAGAAGCTAGAGCAAGGCCTAATTGAAAATGAAGCGAATTATTGA :||||| || ||||:||||||:||||||||||||||||| |||||:||:| 1903 TCCTAACGATGCTAAAGCAAGACCTAATTGAAAATGAAGAGAATTGTTAA 2250 . : . : . : . : . : 2225 TTGTGTCATAAAGACCCTTATGTCCACGCCCCAATCGTCCCCCGGGGGGA | ||:|||||||||||:|||||||| || ||:|| |||||:|| ||:||| 1953 TAGTATCATAAAGACCTTTATGTCCTCGACCTAAACGTCCTCCTGGAGGA 2300 . : . : . : . : . : 2275 ATATGTGCATCTAAAAGGTCTTTCATACTGTGCCCAATCCCGAAATTGGT :|||| |: || |:|| ||||| |||||:|| |||||:||:|||||:|| 2003 GTATGGGTTTCAAGAATTTCTTTGATACTATGACCAATTCCAAAATTAGT 2350 . : . : . : . : . : 2325 TCTATACATATGACCAGCAACGAGAAAAATAAATGCAATAGCTAAATGGT |||||||||||||||||| |::| |||||:|| |||||||||||||||:| 2053 TCTATACATATGACCAGCTATAATAAAAACAACTGCAATAGCTAAATGAT 2400 . : . : . : . : . : 2375 GATGGGCAATATCAGTCAGCCATAAACTTTGCGTTTGTGGATGGAATCCC |:||:||||||||||| ||||||||||||||:|||||||||||:||||| 2103 GGTGAGCAATATCAGTAAGCCATAAACTTTGTGTTTGTGGATGAAATCCA 2450 . : . : . : . : . : 2425 CCGAGAAGAGTTAGAATGGCAGTTCCCGCCCCTTGGGCGGTACCAAATAA ||:| ||:|||||::||:|| ||||| ||||||||:| || ||||| : 2153 CCAATAAAAGTTAAGATAGCTGTTCCAGCCCCTTGAGATGTTCCAAAAGC 2500 . : . : . : . : . : 2475 ATGACTACTTGAATCGGGGTTTTGAGCATAAAGATTCCATTGACCTGTAA ||||:|||||||||||: :||||||||:|||| ||||||||| ||||:|| 2203 ATGATTACTTGAATCGACATTTTGAGCGTAAATATTCCATTGTCCTGCAA 2550 . : . : . : . : . : 2525 AAAGTGGGCCTAACCCTTGGGGATGCGGTAATACATCTAAGAAATTATTC |||:|||:||||::|||| |||||:|||||| : :|||:|||||||:| 2253 AAAATGGACCTAGTCCTTCCGGATGTGGTAATTTTGTTAAAAAATTATCC 2600 . : . : . : . : . : 2575 CACCGAACGTACTCCCCTCTGGATGCAGGAATAGCAACATGAACTAAATG ||:| ||||::|| ||||| ||| | ||||| || |||||||||||||| 2303 CATCTTACGTGTTCGCCTCTTGATTCTGGAATTGCCACATGAACTAAATG 2650 . : . : . : . : . : 2625 CCCTGTCCAAGCCAAGGAACTTACGCCAAAGAGTCCTGACAAATGATGAT |||||||||||:|| ||:|||||:|||||:||||||||:|||||||||| 2353 ACCTGTCCAAGCTAATGAGCTTACACCAAAAAGTCCTGATAAATGATGAT 2700 . : . : . : . : . : 2675 TCAGACGAGATTCGGCATTTTTGAACCAGGAAACGCTCGGTTTCCATTTC |:|:|||||||||:||||||||:|||||||| || :| ||||||||||| 2403 TTAAACGAGATTCAGCATTTTTAAACCAGGATACTTTAGGTTTCCATTTA 2750 . : . : . : . : . : 2725 GGTTGTAGGTGTAACCAACCTGCTATTAAGGATATGGCAGAAAGAAATAA |||||||::||||||||||||||||||||||| ||:| ||||||| | 2453 GGTTGTAAATGTAACCAACCTGCTATTAAGGAAATAGACGAAAGAATAAC 2800 . : . : . : . : . : 2775 TAGAAAAAGAGCACCAGTATAAAGATCTTCATTAGTGCGTAAACCGATTG ||:||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||:|||| 2503 TAAAAAAAGAGCTCCATTATAAAGATCTTGATTAGTTCGTAAACCAATTG 2850 . : . : . : . : . : 2825 TATACCACCACTGATAAACACCAGAATAAGCGATATTCACTGGGCCAAGA ||||||||||:||:|| ||||||||||| || ||||| ||||| |||::| 2553 TATACCACCATTGGTATACACCAGAATATGCTATATTAACTGGTCCAGAA 2900 . : . : . : . : . : 2875 GCACCCCCTCGAGTAAAAGCTTCCACGGCCGGTTGACCAAAATGAGGATC || ||:||||||||||||||||| ||:||:|||||||||||||| ||||| 2603 GCTCCTCCTCGAGTAAAAGCTTCAACAGCTGGTTGACCAAAATGCGGATC 2950 . : . : . : . : . : 2925 CCAAATTGCATGAGCAATAGGTCTTACATGTAAAGGGTCCTGTACCCACG |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||:||| ||||:| 2653 CCAAATTGCATGAGCAATTGGTCTGACATGTAAAGGGTCTTGTCCCCATG 3000 . : . : . : . : . : 2975 ACTCAAAATTTCCTTGCCAAGCTACATGAAACAGATTTCCGGAAGTCCAC :|||||||| ||||||||||| ||:|||||:|:||| ||:||||||||: 2703 CTTCAAAATTACCTTGCCAAGCAACGTGAAATAAATTACCAGAAGTCCAT 3050 . : . : . : . : . : 3025 AGAAAAATTATTGCTAATTGACCAAAGTGAGAAGCAAAAATATTCTGATA |:|||||| |||||||||||||||||:|| || |||||||| ||:||||| 2753 AAAAAAATGATTGCTAATTGACCAAAATGTGACGCAAAAATCTTTTGATA 3100 . : . : . : . : . : 3075 AAGACGTTCCTCAGTAATATCATCATGACTCTCGAAGTCATGTGCGGTAG |||||||||:||||| ||||||||||||||:||:|||||||||||||| | 2803 AAGACGTTCTTCAGTCATATCATCATGACTTTCAAAGTCATGTGCGGTCG 3150 . : . : . : . : . : 3125 CAATACCAAACCAAATACGACGAGTAGTGGGGTCCTGAGCTAAGCCTTGG |||||||||||||||||||||| ||||| |||||:|||| ||:|||:||| 2853 CAATACCAAACCAAATACGACGCGTAGTTGGGTCTTGAGATAGGCCCTGG 3200 . : . : . : . : . : 3175 CTAAACCTTGGAAATCGTAATGCCATAATGCTTTTCAAATCCTCCT AGC |||||::| ||||||| |:|||||||||||||||||||||||||||-||| 2903 CTAAATTTGGGAAATCTTGATGCCATAATGCTTTTCAAATCCTCCTTAGC 3250 . : . : . : . : . : 3224 CATTATCCTACTGCAATAATTCTTGCTAAGAAGAATGCCCATGTTGTGGC ||||||||||||||||||||||||||||::|||||||||||||||||||| 2953 CATTATCCTACTGCAATAATTCTTGCTAGAAAGAATGCCCATGTTGTGGC 3300 . : . : . : . : . : 3274 AATTCCACCCAGAAGGTAATGGGTTACTCCTACAGCACGTCCTTGTATAA |||||||||:|||||||||||:|:||||||||||||||| ||||||:||| 3003 AATTCCACCTAGAAGGTAATGAGCTACTCCTACAGCACGGCCTTGTGTAA 3350 . : . : . : . : . : 3324 TGCTCAAGGCTCTCGGCTGAGTAGCAGGAGCAACTTTTAATTTATTATGA |:||:||||| | |||||::||||||||||||||||||||||:||:||| 3053 TACTTAAGGCGCGAGGCTGGATAGCAGGAGCAACTTTTAATTTGTTGTGA 3400 . : . : . : . : . : 3374 GCCCAAACGATGGATTCAATAAGTTCTTGCCAATAACCACGTCCACTGAA ||||||||:||||||||||||||:||||||||||| ||||| |||||:|| 3103 GCCCAAACAATGGATTCAATAAGCTCTTGCCAATATCCACGACCACTAAA 3450 . : . : . : . : . : 3424 TAGAAACATTAAACTAAAAGCCCAGACAAAATGAGCACCTAGGAAAAAAA ||::||||||||||||||||||||:|||||:||||||||||::|| |||| 3153 TAAGAACATTAAACTAAAAGCCCAAACAAAGTGAGCACCTAAAAATAAAA 3500 . : . : . : . : . : 3474 GGCCATATGCAGATAATGAAGAACCATAAGACTGAATTACCTGGGATGCC |:||||| |||||||| ||||||||||||||:||||||||:||:|| ||: 3203 GACCATAAGCAGATAAGGAAGAACCATAAGATTGAATTACTTGAGAAGCT 3550 . : . : . : . : . : 3524 TGTGCCCATAAGAAATCGCGGAGCCACCCATTAATAGTAATAGAACTTTG |||||||||||:||:||:||:||||| |||||||||||||||| :||||| 3253 TGTGCCCATAAAAAGTCACGAAGCCAACCATTAATAGTAATAGCGCTTTG 3600 . : . : . : . : . : 3574 CGCAAAGTTTCCTCCCGTGATATGAGTTACTACCCCTTGATCACTTACAC :|||||:||||| || ||:||||||||||| || ||||| ||:||||:| 3303 TGCAAAATTTCCACCGGTAATATGAGTTACAACACCTTGCTCGCTTATAG 3650 . : . : . : . : . : 3624 TGCCCCAAACATCTGACTGCATTTTCCAACTGAAATGGAATATTACTACC |:||||||||||| ||:||||||||||||||:||:||:|| || ||||| 3353 TACCCCAAACATCAGATTGCATTTTCCAACTAAAGTGAAAAATAACTACA 3700 . : . : . : . : . : 3674 GAAATTGCATTGTACATCCAGAATAGTCCTAAGAAGACATGATCCCAGGC ||||| | |||:||||||||:||||: ||||||||:||||||||||| || 3403 GAAATAGAATTATACATCCAAAATAAACCTAAGAAAACATGATCCCATGC 3750 . : . : . : . : . : 3724 CGATACTTGACATGTACCCCCTCTTCCAGGTCCATCACAAGGAAAACGAA ||||||||||| || ||:|||||||||||||||||:||||||||||||| 3453 AGATACTTGACAAGTTCCTCCTCTTCCAGGTCCATCGCAAGGAAAACGAA 3800 . : . : . : . : . : 3774 AACCAAGGTTTGCTTTATCCGGTGTCAAACGGGAACTGCGAGCAAATAGA |||||||:|| |||||:||:|||:|||||||:||||| ||||||||||:| 3503 AACCAAGATTAGCTTTGTCTGGTATCAAACGAGAACTTCGAGCAAATAAA 3850 . : . : . : . : . : 3824 ACACCTTTCAAGAGTATCAGTGCCGTCACATGAATCGTAAATGCATGAAT ||||||||:|| |: ||:|: :| ||:||||||||:|||||||||||||| 3553 ACACCTTTTAATAAAATTAAAACAGTTACATGAATTGTAAATGCATGAAT 3900 . : . : . : . : . : 3874 GTGATGTACCAAGAAATCCGCGGTTCCTAATGGAATAGGCAACAAAGCCA :||||||||:||:|||||:|| ||||||||:||||| ||:||:||||| | 3603 ATGATGTACTAAAAAATCTGCTGTTCCTAACGGAATTGGTAATAAAGCAA 3950 . : . : . : . : . : 3924 CCTTGCCACCCACTGCCACTAAATCACCACCCCCCCAAGTTAAACTGGTA |:||:|:||| |||||:|:|| :|| ||||| ||||| ||||||||:||| 3653 CTTTACTACCAACTGCTATTACGTCTCCACCACCCCATGTTAAACTAGTA 4000 . : . : . : . : . : 3974 CTTGCTGTTGCACCAGGAGCCGTTGCACCAGGTGCTAAAGCATGGGTGTT ||||||: |||::|||||| || : ::: |||||||||||||| ||||| 3703 CTTGCTAAAGCATTAGGAGCAGTAAAGTTTGGTGCTAAAGCATGTGTGTT 4050 . : . : . : . : . : 4024 TTGTATCCATTGAGCAAAAACGGGTTGTAATTGTATAGCGGTATCTGAAA |||||||||||||||||||||:||||||||||| |||||:|||||||||| 3753 TTGTATCCATTGAGCAAAAACAGGTTGTAATTGAATAGCAGTATCTGAAA 4100 . : . : . : . : . : 4074 ACATATCTTGAGGACGCCCTAAAGCGCTCATGGTATCATTATGAATATAC ||||||||||||||||:||||||||:||||| |||||||||||||||||: 3803 ACATATCTTGAGGACGTCCTAAAGCACTCATCGTATCATTATGAATATAT 4150 . : . : . : . : . : 4124 AAACCAAAACTGTGAAAGCCTAGAAATATACATGCCCAGTTGAGATGGGA || ||||||||:||||| ||||:||| ||:|||:||||:||:||||| || 3853 AATCCAAAACTATGAAATCCTAAAAAGATGCATACCCAATTAAGATGTGA 4200 . : . : . : . : . : 4174 TATGATTGCATCACGATGTCTAAGGACACGATCTAATAGATCGTTGTACC ||| |||||||||||||||| |||:|| ||||||||:|:||:||||||:: 3903 TATTATTGCATCACGATGTCGAAGAACTCGATCTAACAAATTGTTGTATT 4250 . : . : . : . : . : 4224 GAGTAGTTGGATCATAATCTCTTACCATAAAAATGGCTGCATGCGCGGCA ||||||||||||||||||||||||||||||||||:|| |||||:||:||| 3953 GAGTAGTTGGATCATAATCTCTTACCATAAAAATAGCAGCATGTGCAGCA 4300 . : . : . : . : . : 4274 GCACCAACTATGAGAAATCCACCAATCCACATGTGATGTGTGAACAATGA ||||||||||| |:||||||||||||||||||:||||||||:|| |: || 4003 GCACCAACTATTAAAAATCCACCAATCCACATATGATGTGTAAAAAGAGA 4350 . : . : . : . : . : 4324 CAGTTGTGTACCATAGTCAGTAGCTAGATACGGATAAGGGGGCATGGAAT ||||| |||||:||:||||||||||:|||:||||||||:|||||:| :| 4053 AAGTTGAGTACCGTAATCAGTAGCTAAATATGGATAAGGAGGCATAGCGT 4400 . : . : . : . : . : 4374 ACATATGGTGAGCTACAACAATGGTTAAAGAGCCTAACATAGCTAAGTTA |||||||:||||||||||:|||:||||||||:||:|||||||||||:||| 4103 ACATATGATGAGCTACAATAATAGTTAAAGAACCCAACATAGCTAAATTA 4450 . : . : . : . : . : 4424 AGAGATAATTGAGCATGCCATGACGTTGTTAGGATCTCATATAGGCCTTT || | |||||||||||||||||| |||||||::||:||||| ||:||||| 4153 AGTGCTAATTGAGCATGCCATGAAGTTGTTAAAATTTCATAAAGACCTTT 4500 . : . : . : . : . : 4474 ATGGCCCTGACCTGTAAATGGACCTTTATGAGCTTCTAAAATATCTTTTA |||:|||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | 4203 ATGACCCTCTCCAGTAAATGGACCTTTATGAGCTTCTAAAATTTCTTTAA 4550 . : . : . : . : . : 4524 GTCCATGACCAATACCCCAGTTGGTCCTATACATGTGACCCGCTATCAGG : |:||||||:|||||||||||:|| | ||||||:|||||:||||::|:: 4253 AACTATGACCGATACCCCAGTTAGTACGATACATATGACCTGCTACTAAA 4600 . : . : . : . : . : 4574 AAAAGAATTGCAATAGCTAAATGGTGATGGGCAATATCAGTCAGCCACAG |||||||:|||||||||||||||:|||||:|| :|||||||:|:|||:|: 4303 AAAAGAACTGCAATAGCTAAATGATGATGAGCTGTATCAGTTAACCATAA 4650 . : . : . : . : . : 4624 ACCCCCAGTTACTGGATCTAATCCTCCACGAAAAGTAAGAAAGTCCGCAT ||| |||||||||||||: |:||||||||||||||| |:|||||| | || 4353 ACCGCCAGTTACTGGATTAAGTCCTCCACGAAAAGTTAAAAAGTCAGAAT 4700 . : . : . : . : . : 4674 ATTTTGACCAATTCAAGGTGAAAAATGGGGTTGCTCCCTCGGCAAAACTG |||:|||||||||:||:||:||||| ||:|||: :||:|: ||||||||: 4403 ATTCTGACCAATTTAAAGTAAAAAAAGGAGTTAACCCTTTTGCAAAACTA 4750 . : . : . : . : . : 4724 GGATAAAGTTGAGCCAAAAGATCTCGATTCAAGATAAATTCATGAGGAAG ||:||||||| |||:|||||||| |||||:||:||||||||||||||||| 4453 GGGTAAAGTTCAGCTAAAAGATCACGATTTAAAATAAATTCATGAGGAAG 4800 . : . : . : . : . : 4774 TGGTATCTCTTTAGGATCTACTCCAGCGTTTAGAAATTGGTTAATCGGTA |||||:||||| ||||| ||||||||:|:||:||::||:||||| |||| 4503 AGGTATTTCTTTTGGATCAACTCCAGCATCTAAAAGCTGATTAATAGGTA 4850 . : . : . : . : . : 4824 AAGATACATGTACTTGATGCCCCGCCCAAGAGAGAGACCCAAGTCCTAGT |||| ||||||||||||||:|| ||||||||:||||| || |: ||||: 4553 AAGAAACATGTACTTGATGTCCAGCCCAAGAAAGAGAACCTAAGCCTAAA 4900 . : . : . : . : . : 4874 AGCCCTGCCAAATGGTGATTCAGCATAGATTCTACATCTTGAAACCAAGC || |||||:|||||:|||||:||||||||||| ||||||||||||||||| 4603 AGACCTGCTAAATGATGATTTAGCATAGATTCAACATCTTGAAACCAAGC 4950 . : . : . : . : . : 4924 CAATTTTGGCGCCGCTTTATGATAATGAAACCAACCAGCAAAAAGCATTA :|||||||| || |||||:|||||||||||||| || ||||||||||||| 4653 TAATTTTGGAGCAGCTTTGTGATAATGAAACCATCCTGCAAAAAGCATTA 5000 . : . : . : . : . : 4974 ACGCTGCAAAGACCAATGCCCCAATTGCTGTACAATAGAGTTGTAATTCA |:||||||||:||:||| | |||||||| ||| ||||:|||||||||||| 4703 ATGCTGCAAAAACTAATCCACCAATTGCAGTAGAATAAAGTTGTAATTCA 5050 . : . : . : . : . : 5024 CTAGTTATTCCAGATGCTCGCCAAATCTGAAAAAAACCAGAGGTTATTTG ||||||||||||||||||||||||| :||||||||:||:||||||||||| 4753 CTAGTTATTCCAGATGCTCGCCAAAGTTGAAAAAAGCCGGAGGTTATTTG 5100 . : . : . : . : . : 5074 TATTCCTCGGAAACCCCCGCCTACGTCACCATTTAATATTTCTTGGCCCA |||||||:|:||||||||||| ||:|| |||||||| ||||||||:|| | 4803 TATTCCTTGAAAACCCCCGCCAACATCCCCATTTAAAATTTCTTGACCAA 5150 . : . : . : . : . : 5124 CTATTGGCCAAACCACCTGGGCACTAGGCCCAATGTGAGTTGGATCACTT |||| |||||||| ||:||:|||||:|||::|||:||||| ||||||||| 4853 CTATAGGCCAAACAACTTGAGCACTGGGCTTAATATGAGTAGGATCACTT 5200 . : . : . : . : . : 5174 AGCCACGCTTCATAATTAGAAAAACGAGCACCGTGGAAATACATGCCGCT |:|||:||||||||||||||||||||||||||:||:||:|||||:||:|| 4903 AACCATGCTTCATAATTAGAAAAACGAGCACCATGAAAGTACATACCACT 5250 . : . : . : . : . : 5224 CAGCCAAAGAAAGATGATGGAGAGTTGACCGAAATGTGCACTAAATACTT :|:||||| |||:||||||| |:||| ||:||||| |||||||| ||:| 4953 TAACCAAATAAAAATGATGGCTAATTGCCCAAAATGAGCACTAAAAACCT 5300 . : . : . : . : . : 5274 TTCGAGAGATCTCCTCCAAATCACTGGTATGGCTATCGAAATCGTGAGCA | |||||:||:||:||:||||||:||||||||||:||:|||||:|||||| 5003 TACGAGAAATTTCTTCTAAATCATTGGTATGGCTGTCAAAATCATGAGCA 5350 . : . : . : . : . : 5324 TCAGCATGTAGGTTCCAGATCCAAGTGGTAGTATCAGGCCCTTTAGCTAT ||||||||||::|||||:|||||||||||||||::||| ||:||||||| 5053 TCAGCATGTAAATTCCAAATCCAAGTGGTAGTACTAGGACCCTTAGCTAG 5400 . : . : . : . : . : 5374 TGTTCTTGAGAAATGACCCGGTCTGGCCCATTCCTCGAACGAAGTTTTTA ||:|||||:||||| || |||:|:|||||||::||:|| ||:||||||| 5103 AGTCCTTGAAAAATGCCCAGGTTTAGCCCATTTTTCAAAAGAGGTTTTTA 5450 . : . : . : . : . : 5424 CGGGATCCCTATCTACCAAAATTTTAACTTCTGGTTCCGGCGAACGAATA |:||||||:| ||:|||| |||:||:||||||||||||||:||||||||| 5153 CAGGATCCTTTTCCACCACAATCTTGACTTCTGGTTCCGGTGAACGAATA 5500 . : . : . : . : . : 5474 ATCATTGAG TCCTCCTCTTTCCGGACAACACATACAAAGAGACCCGCCA :||||:|||-|:|||||||:|:|:|||:| :|||| :||-|:|||::||| 5203 GTCATCGAGGTTCTCCTCTCTTCAGACGAGGCATAGGAA AAACCTACCA 5550 . : . : . : . : . : 5523 ACAGTCAAATAATTAGTGAACCTTAGAGATAGAGAGATATTTCTATAATT |||-----|||||||||:|||:|: |||| | | |||| || |---- 5252 ACA ATAATTAGTAAACTTCTGAGAGATCCATATATAACTTT 5600 . : . : . : . : . : 5573 AGTTCGTTTCTCTTCTATTTTTCTATCTCCCATCTATCTATTTTCTTTAG ---------------|| |:||| ||||-------------------|| 5293 TAGATCTCTTTCTC AG 5650 . : . : . : . : . : 5623 TTATTTACTAGAGCAATTATGATCTGGAAGTCGATCCGGGGCAAGTGTTC || |||:||:|||:||| || ::|||:|::--|| :||||:|| ||| 5309 TTTAAAACTGGAACAACTATTATACAGAAATTA CCTAGGCAGGTCTTC 5700 . : . : . : . 5673 GGATCTATTATGACATAGCCTTGAGGCGCTCAACGGACC ::||:||||||||||:|:::||:|||:|||:||:||||| 5357 AAATTTATTATGACACAATTTTAAGGTGCTTAATGGACC ********************************************************* Number 2 Local Alignment Similarity Score : 278.4 Match Percentage : 55% Number of Matches : 1171 Number of Mismatches : 711 Total Length of Gaps : 218 Begins at (1156, 3100) and Ends at (3152, 5084) 0 . : . : . : . : . : 1156 TGAGCCCATGCTAAAGTTTCAATCAATTCCTGCCAATATCCACGCCAAGA |||||||| :| | :| |||||| |::||:|||||||||||||| | | 3100 TGAGCCCAAACAATGGATTCAATAAGCTCTTGCCAATATCCACGACCACT 50 . : . : . : . : . : 1206 AATTAAGAACATAAATCCAGTAGCCCAAACAAGATGTCCAAATAAGAACA || ||||||||| || |:|: |||||||||||::|| || |||:||:| 3150 AAATAAGAACATTAAACTAAAAGCCCAAACAAAGTGAGCACCTAAAAATA 100 . : . : . : . : . : 1256 TCCATGCCCAAACCGATAAACTATTCATACCAAAAGGATTATATCCGTTG : | :||:| |||||: ------------|||:|::||| | : 3200 AAAGACCATAAGCAGATAAGG AAGAACCATAAGATTGA 150 . : . : . : . : . : 1306 ATAAGTTGTGAAGAGTTTAACCATAAATAATCCCTTAACCAGCCCATCAA || | ||| |||| | |: ||||||| |:|| | |:|||:|| | | 3238 ATTACTTGAGAAGCTTGTGCCCATAAAAAGTCACGAAGCCAACCATTAAT 200 . : . : . : . : . : 1356 ATAA GTGGAAGATT CATTAAACTGTGAAACGTTAC | |----------||| ||:|||-----|: ||| || | ||: :|| 3288 AGTAATAGCGCTTTGTGCAAAATTTCCACCGGTAATATGAGTTACAACAC 250 . : . : . : . : . : 1391 CCTGC CATAATGTGATGTGCTTCCAATG |:|||----------------------|| | ||:: |----||||||: 3338 CTTGCTCGCTTATAGTACCCCAAACATCAGATTGCATT TTCCAACT 300 . : . : . : . : . : 1419 CCAATAAAAAGTAACCCATCCAATAGTATTTAACATCCAAAAAACTGCCA |:|:||||:||||: ||||| ||| |||||||||| | |:| 3384 AAAGTGAAAAATAACTACAGAAATAGAATTATACATCCAAAATAAACCTA 350 . : . : . : . : . : 1469 AATAAAACGCGTCCCATGCCGAAATATCACAAGTACCGCCTCGTCCTGGG |: ||| :|||||||| || |: | |||||| || |||| ||| || 3434 AGAAAACATGATCCCATGCAGATACTTGACAAGTTCCTCCTCTTCCAGGT 400 . : . : . : . : . : 1519 CCATCGCACGGAAAACTATAACCGAAATCCTTTTTATCTGGCATTAACTT |||||||| ||||||| | ||||:|:||: :|||:|||||:||:|| : 3484 CCATCGCAAGGAAAACGAAAACCAAGATTAGCTTTGTCTGGTATCAAACG 450 . : . : . : . : . : 1569 GGAACCACGTGCATCTAAAGCACCTTTTACTAAGATCAATGTAGTTGTAT :||||: || ||| ||||:||||||||| |||:||:|| ::||||::|| 3534 AGAACTTCGAGCAAATAAAACACCTTTTAATAAAATTAAAACAGTTACAT 500 . : . : . : . : . : 1619 GTAAACCAAGAGCAATAGCATGATGAACCAAAAAGTCTCCAGGACCTATT | | :||: ||| |::|||||| ||:|||||:||| | | |||| : 3584 GAATTGTAAATGCATGAATATGATGTACTAAAAAATCTGCTGTTCCTAAC 550 . : . : . : . : . : 1669 GTTAAAAATAATGAATTACTATTTTCATTAACAGCATTTAACCAACCCGG | | ::||||:|| :| : || ::|::||| || |||--|: |:| : 3634 GGAATTGGTAATAAAGCAACTTTACTACCAACTGCTATTA CGTCTCCA 600 . : . : . : . : . : 1719 CAACCAGATGCTTCGACCCGCATTGAATGCTGGACCACTCGTTGAAGATA | ||| |||-|| :||: |:|:|---||||::| ||:| | | || | 3682 CCACCCCATG TTAAACTAGTACT TGCTAAAGCATTAGGAGCAGTAA 650 . : . : . : . : . : 1769 AAAGTACATCGAACCCATATGAAGTTTTACCATGAGCGGATTGTATCCAT |:---------------| ||: |:| | |||| |:| |||||||||| 3728 AG TTTGGTGCTAAAGCATGTGTGTTTTGTATCCAT 700 . : . : . : . : . : 1819 TGAGCAAATATAGGTTCAATCAAGATTTGCTTCTCCG |||||||| |:||||| | : ::|| | ||:|------------- 3763 TGAGCAAAAACAGGTTGTAATTGAATAGCAGTATCTGAAAACATATCTTG 750 . : . : . : . : . : 1856 GAGTGCCAAAGGCAAGCATGACATCATTATGAACATAAAGTCCCAGGG --|| || ||:||| ||| ::|||||||||||:||| |:||| |:: 3813 AGGACGTCCTAAAGCACTCATCGTATCATTATGAATATATAATCCAAAAC 800 . : . : . : . : . : 1904 TATGGAATCCCAGAAAGAGGCTGGCCCAACTTAAATGAGATATGATAGCT ||||:|||||:|:||||| || :|||||:| |:||| ||||| || || 3863 TATGAAATCCTAAAAAGATGCATACCCAATTAAGATGTGATATTATTGCA 850 . : . : . : . : . : 1954 TCTTTATGCTCTAACATTCTTGCCAATACATTATCTTCATTTTGCTCCGG || : |||:: |: |:|| |:||:| |||:|: | | ::|| 3913 TCACGATGTCGAAGAACTCGATCTAACAAATTGTTGTATTGAGTAGTTGG 900 . : . : . : . : . : 2004 ATTGTAATCTCTAATGAAAAATATAGCTCCATGAGCAAAAGCTCCTGTCA ||::|||||||| |: | ||| ||||| |||| |||: ||| || :::| 3963 ATCATAATCTCTTACCATAAAAATAGCAGCATGTGCAGCAGCACCAACTA 950 . : . : . : . : . : 2054 TGATGAATCCTGCGATATATTGGTGGTGGGTATATAATGCAGCTTGAGTA | | :||||| |:|| :|: :||:|| ||| | |: | |: ||||||| 4013 TTAAAAATCCACCAATCCACATATGATGTGTAAAAAGAGAAAGTTGAGTA 1000 . : . : . : . : . : 2104 GTAAAGTCTTGTGCTATGAATGCATAAGCAGGTAAAGAGTACATGTGTTG :: |:|| |||| : ||| ||||| |||:| || ||||||:|| || 4063 CCGTAATCAGTAGCTAAATATGGATAAGGAGGCATAGCGTACATATGATG 1050 . : . : . : . : . : 2154 AGCTACCAAAGAAGTAATAACCCCTAAAGAAGCTAGAGCAAGGCCTAATT |||||| | |: ||| | |: ||:|| : |||||:| :||| |||||| 4113 AGCTACAATAATAGTTAAAGAACCCAACATAGCTAAATTAAGTGCTAATT 1100 . : . : . : . : . : 2204 GAAAATGAAGCGAATTATTGATTGTGTCATAAAGACCCTTATGTCCACGC ||: ||| ::||| | | | :| |||||||||||:||||| || : : 4163 GAGCATGCCATGAAGTTGTTAAAATTTCATAAAGACCTTTATGACCCTCT 1150 . : . : . : . : . : 2254 CCC AATCGTCCCCCGGGGGGAATATGTGCATCTAAAAGGTCTTTCAT || ---||| | ||::---------|||| || ||||||| ||||| | 4213 CCAGTAAATGGACCTT TATGAGCTTCTAAAATTTCTTTAAA 1200 . : . : . : . : . : 2301 ACTGTGCCCAATCCCGAAATTGGTTCTATACATATGACCAGCAACGAGAA |||:|| ||:|| || |:||:|| | |||||||||||| || || |:|| 4254 ACTATGACCGATACCCCAGTTAGTACGATACATATGACCTGCTACTAAAA 1250 . : . : . : . : . : 2351 AAATAAATGCAATAGCTAAATGGTGATGGGCAATATCAGTCAGCCATAAA ||| || |||||||||||||||:|||||:|| :|||||||:|:||||||| 4304 AAAGAACTGCAATAGCTAAATGATGATGAGCTGTATCAGTTAACCATAAA 1300 . : . : . : . : . : 2401 CTTTGCGTTTGTGGATGGAATCCCCCGAGAAGAGTTAGAATGGCAGTTCC |: : ||| ||||| :|:|||:||: |||:|||||:|| | |||---- 4354 CCGCCAGTTACTGGATTAAGTCCTCCACGAAAAGTTAAAAAGTCAG 1350 . : . : . : . : . : 2451 CGCCCCTTGGGCGGTACCAAATAAATGACTACTTGAATCGGGGTTTTGAG ------------------|| ||||:| || || ------------ 4400 AATATTCTGACCAATTTAAA 1400 . : . : . : . : . : 2501 CATAAAGATTCCATTGACCTGTAAAAAGTGGGCCTAACCCTTGGGGA --------------------|||||||: ||: :|||||||| | |--- 4420 GTAAAAAAAGGAGTTAACCCTTTTGCAAAA 1450 . : . : . : . : . : 2548 TGCGGTAA TACATCTAAGAAATTA -|: |||||--| || ||||:|:||:|----------------------- 4450 CTAGGGTAAAGTTCAGCTAAAAGATCACGATTTAAAATAAATTCATGAGG 1500 . : . : . : . : . : 2572 TTCCACCGAACGTACTCC CCTCTGGATGC AG ---------|||: ::|:|: |||||--| |||::| ||--------|| 4500 AAGAGGTATTTCTTTTGGATCAACTCCAGCATCTAAAAGCTGATTAATAG 1550 . : . : . : . : . : 2603 GAATAGCAACATGAACTAAATGCCCTGTCCAAGCCAAGGAACTTACGCCA | | || |||||| ||| :|||:|| |:||||| |::||||:|| ||| 4550 GTAAAGAAACATGTACTTGATGTCCAGCCCAAGAAAGAGAACCTAAGCCT 1600 . : . : . : . : . : 2653 AAGAGTCCTGACAAATGATGATTCAGACGAGATTCGGCATTTTTGAACCA ||:|| |||| :|||||||||||:|| ||||||::|||:|| :||||| 4600 AAAAGACCTGCTAAATGATGATTTAGCATAGATTCAACATCTTGAAACCA 1650 . : . : . : . : . : 2703 GGAAACGCTCGGTTTCCATTTCGGTTGTAGGTGTAACCAACCTGCTATTA :| | :|:|| : ||| | |: ---|| ||||| ||||| | | 4650 AGCTAATTTTGGAGCAGCTTTGTGATAA TGAAACCATCCTGCAAAAA 1700 . : . : . : . : . : 2753 AGGATATGGCAGAAAGAAATAATAGAAAAAGAGCACCAGTATAAAGATCT : : || || | ||:|| |||| | || ||| :|| |||||| | | 4697 GCATTAATGCTGCAAAAACTAATCCACCAATTGCAGTAGAATAAAGTTGT 1750 . : . : . : . : . : 2803 TCATTAGTGCGTAAACCGATTGTATACCACCACTGATAAACACCAGAATA |:| |: || ||:: ||: ::||| ::||| ||| :||:||--- 4747 AATTCACTAGTTATTCCAGATGCTCGCCAAAGTTGAAAAAAGCCGGA 1800 . : . : . : . : . : 2853 AGCGATATTCACTGGGCCAAGAGCACCCCCTCGAGTAAAAGCTTCCACGG ---|:| |: |: || ||: |||||| | |::| | |::| :: 4794 GGTTATTTGTATTCCTTGAAAACCCCCGCCAACATCCCCATTTAAAA 1850 . : . : . : . : . : 2903 CCGGTTGACCAAAATGAGGATCCCAAATTGCATGAGCAATAGGTCTTACA :: |||||||| |||---|||||: :| |||||| |:||::| |:| 4841 TTTCTTGACCAACTATAGG CCAAACAACTTGAGCACTGGGCTTAATA 1900 . : . : . : . : . : 2953 TGTAAAGGGTCCTGTACCCACGACTCAAAATTTCCTTGCCAAGCTACATG || : |||:|| : || |||:| :||| |||| : |:||| |||| 4888 TGAGTAGGATCACTTAACCATGCTTCATAATTAGAAAAACGAGCACCATG 1950 . : . : . : . : . : 3003 AAACAGATTTCCGGAAGTCCACAGAAAAATTATTGCTAATTGACCAAAGT ||| : | ||: : ||| | |||||| || |||||||| |||||:| 4938 AAAGTACATACCACTTAACCAAATAAAAATGATGGCTAATTGCCCAAAAT 2000 . : . : . : . : . : 3053 GAGAAGCAAAAATATTCTGATAAAGACGTTCCTCAGTAATATCATCATGA ||| | :|||||: || :|| ||| ---|||:|| : | :||:: :|||: 4988 GAGCACTAAAAACCTTACGAGAAAT TTCTTCTAAATCATTGGTATGG 2050 . : . : . : . : . : 3103 CTCTCGAAGTCATGTGCGGTAGCAATACCAAACCAAATACGACGAGTAGT || ||:||:||||| ||: :|||| | |||||| |:| :||||| 5035 CTGTCAAAATCATGAGCATCAGCATGTAAATTCCAAATCCAAGTGGTAGT ********************************************************* Number 3 Local Alignment Similarity Score : 255.2 Match Percentage : 57% Number of Matches : 788 Number of Mismatches : 417 Total Length of Gaps : 159 Begins at (3371, 884) and Ends at (4659, 2163) 0 . : . : . : . : . : 3371 TGAGCCCAAACGATGGATTCAATAAGTTCTTGCCAATAACCACGTCCACT |||||||||:| | :| ||||||||||||||||||||| |||||:| 884 TGAGCCCAAGCTAAAGTTTCAATAAGTTCTTGCCAATATCCACGCCACGA 50 . : . : . : . : . : 3421 GAATAGAAACATTAAACTAAAAGCCCAGACAAAATGAGCACCTAGGAAAA | :|||||||| || |:|: ||||||:|| |||||| || ||----|| 934 TATCAGAAACATAAATCCAGTAGCCCAAACTAAATGACCAAATA AA 100 . : . : . : . : . : 3471 AAAGGCCATATGCAGATAATGA AGAACCATAAGA || : ||||:: ||:|:|: |----------------||:|::||| 980 AACATCCATGCCCAAACAGACAGACTATTCATACCAAAAGGATTATATCC 150 . : . : . : . : . : 3505 CTGAATTACCTGGGATGCCTGTGCCCATAAGAAATCGCGGAGCCACCCAT | |||:| :|| || | | |: ||||||: |||| | |:||| || 1030 ATTAATCAATTGTGAAGAATTTAACCATAAATAATCTCTTAACCAGCCCA 200 . : . : . : . : . : 3555 TAATAGTAATAGAACTTTGCGCAAAGTTTCCTCC CGTGATATGAG | | | :||||| || :||| | | || |-----| || :||:| 1080 TTAAATATGTAGAAGATTCATTAAATTGTGCTGCATTTCCTTGCCATAAT 250 . : . : . : . : . : 3600 TTACTACCCCTTGATCACTTACACTGCCCCAAACATCTGACTGCATTTTC || ||: --------------------------------------|||| 1130 GTAATATG TTTC 300 . : . : . : . : . : 3650 CAACTGAAATGGAATATTACTACCGAAATTGCATTGTACATCCAGAATAG |||: |||::|| :| ||: : ||| |:||| |||||||:|| | 1142 CAATGCCAATAAAAAGTAACCCATCCAATAGTATTTAACATCCAAAAAAC 350 . : . : . : . : . : 3700 TCCTAAGAAGACATGATCCCAGGCCGATACTTGACATGTACCCCCTCTTC | ||||: |:| | ||||||:|| || |: | ||| ||||| |||| || 1192 TGCTAAATAAAAAGCATCCCAAGCAGAAATATCACAAGTACCACCTCGTC 400 . : . : . : . : . : 3750 CAGGTCCATCACAAGGAAAACGAAAACCAAGGTTTGCTTTATCCGGTGTC |||| |||||||||||||||| | ||||||: |:| :||||||:||::|: 1242 CAGGACCATCACAAGGAAAACTATAACCAAATTCTTTTTTATCTGGCATT 450 . : . : . : . : . : 3800 AAACGGGAACTGCGAGCAAATAGAACACCTTTCAAGAGTATCAGTGCCGT || : :|| |: || ||| ||:|:||||||||| |: ||:|:||: || 1292 AATTTAGATCCTCGTGCATCTAAAGCACCTTTCACTAAAATTAATGTAGT 500 . : . : . : . : . : 3850 CACATGAATCGTAAATGCATGAATGTGATGTACCAAGAAATCCGCGGTTC ::||| | : || ||| |::|||||||||:||:||:||: |:| | 1342 AGTATGTAAACCTAAAGCAATAGCGTGATGTACTAAAAAGTCTCCAGGAC 550 . : . : . : . : . : 3900 CTAATG GAATAG GCAACAAAGCCA | | ||----||| ||----------------------||| | || | | 1392 CAATTGTTAAGAAAAGTGAATTACTATTATTATTTATAGCATCTAACCAA 600 . : . : . : . : . : 3924 CCTTGCCACCCACTGC CACTAAATCACCACCCCCCCAAGTT || |: ||| |||---------||:||||| ---------------- 1442 CCAGGTAACCATATGCTTTGACCAGCATTAAATG 650 . : . : . : . : . : 3965 AAACTGG TACTTGCTGTTGCACCAGGAGCCGTTGCACCAGGT GCT ---||||--||:|||:|| || |:| :| : : |||| :|---||| 1476 CTGGATTATTTGTTGATGATAAAAGTACATCAAAACCATATAAAGCT 700 . : . : . : . : . : 4010 AAAGCATGGGTGTTTTGTATCCATTGAGCAAAAACGGGTTGTAATTGTAT | ||||:|:: ||||||||||||||||||||::|||| | | ---- 1523 TTACCATGAGCAGATTGTATCCATTGAGCAAAAATAGGTTCAATTA 750 . : . : . : . : . : 4060 AGCGGTATCTGAAAACATATCTTGAGGACGCCCTAAAGCGCTCATGGTAT -----------||| : |:|| |||| || |||||: |||:::|| 1569 AAATTTGTTTTTCAGGAGTACCAAAAGCAAGCATAACAT 800 . : . : . : . : . : 4110 CATTATGAATATACAAACCAAAACTGTGAAAGCCTAGAAATATACATGCC |||||||||::|| |:||| ||| |:||||| |||||||||| || ||| 1608 CATTATGAACGTAAAGACCTAAAGTATGAAATCCTAGAAATAAACTAGCC 850 . : . : . : . : . : 4160 CAGTTGAGATGGGATATGATTGCATCACGATGTCTAAGGACACGATCTAA ||::| |:||||||||| || || || : ||||:: |: |: | | |||| 1658 CAACTTAAATGGGATATTATAGCTTCTTTATGTTCTAACATTCTAGCTAA 900 . : . : . : . : . : 4210 TAGATCGT TGTACCGAGTAGTTGGATCATAATCTCTTACCAT || ||::|--------||| |||--------|||:||||||||| |: | 1708 TACATTATCTTTATTTTGTTCCG GATTATAATCTCTAATAAA 950 . : . : . : . : . : 4252 AAAAATGGCTGCATGCGCGGCAGCACCAACTATGAGAAATCCACCAATCC :|||||:||| |||| ||:: |||||| :::||:| ||| ||| |||| : 1750 GAAAATAGCTCCATGAGCAAAAGCACCTGTCATAATAAAACCAGCAATAT 1000 . : . : . : . : . : 4302 ACATGTGATGTGTGAACAATGACAGTTGTGTACCATAGTCAGTAGCTAGA |: :||||| ||: |:|||| : |||:|| :| |:|| || ||| 1800 ATTGATGATGAGTATATAATGCAGCTTGCGTTGTAAAATCTTGTGCAAGA 1050 . : . : . : . : . : 4352 TACGGATAAGGGGGCATGGAATACATATGGTGAGCTACAACAATGGTTAA ||| |||:||:||:| :||||||||||| |||||||| | :: ||| | 1850 AACGCATAGGGAGGTAAAGAATACATATGTTGAGCTACTAAGGAGGTAAT 1100 . : . : . : . : . : 4402 AGAGCCTAACATAGCTAAGTTAAGAGATAATTGAGCATGCCATGACGTTG |: ||||||: |||||: :|||| |||||||: ||| : || | 1900 AACTCCTAACGATGCTAAAGCAAGACCTAATTGAAAATGAAGAGAATTGT 1150 . : . : . : . : . : 4452 TTAGGATCTCATATAGGCCTTTATGGCCCTGACCTGTAAATGGACCTT | | ::| ||||| ||:|||||||| ||::|||||: | :| ||| -- 1950 TAATAGTATCATAAAGACCTTTATGTCCTCGACCTAAACGTCCTCCTGGA 1200 . : . : . : . : . : 4500 TATGAGCTTCTAAAATATCTTTTAGTCCATGACCAATACCCCAGTT ----||||:|:||| |:||| ||||| | |:||||||||| || |:|| 2000 GGAGTATGGGTTTCAAGAATTTCTTTGATACTATGACCAATTCCAAAATT 1250 . : . : . : . : . : 4546 GGTCCTATACATGTGACCCGCTATCAGGAAAAGAATTGCAATAGCTAAAT :||:||||||||:||||| ||||| | :|||| ||:|||||||||||||| 2050 AGTTCTATACATATGACCAGCTATAATAAAAACAACTGCAATAGCTAAAT 1300 . : . : . : . : . : 4596 GGTGATGGGCAATATCAGTCAGCCACAGACCCCCAGTTACTGGATCTAAT |:||:||:||||||||||| |||||:|:||::: ||| ||||| ||| 2100 GATGGTGAGCAATATCAGTAAGCCATAAACTTTGTGTTTGTGGATGAAAT 1350 . : 4646 CCTCCACGAAAAGT || ||| |||||| 2150 CCACCAATAAAAGT ********************************************************* Number 4 Local Alignment Similarity Score : 37.4 Match Percentage : 64% Number of Matches : 89 Number of Mismatches : 45 Total Length of Gaps : 3 Begins at (4829, 2339) and Ends at (4962, 2475) 0 . : . : . : . : . : 4829 ACATGTACTTGATGCCCCGCCCAAGAGAGAGACCCAAGTCCTAGTAGCCC ||||| ||| :||| ||:|:||||| |: || |: | || |: ||:|| 2339 ACATGAACTAAATGACCTGTCCAAGCTAATGAGCTTACACCAAAAAGTCC 50 . : . : . : . : . : 4879 TGCCAAATGGTGATTCAGCATAGATTCTACATCTTGAAACCAAGCCAATT || :|||||:|||||:|: |||||| :|||:|| ||||||:| :| || 2389 TGATAAATGATGATTTAAACGAGATTCAGCATTTTTAAACCAGGATACTT 100 . : . : . : . 4929 TTGGCGCCGCTTTATGAT AATGAAACCAACCAGC | ||: :| |||| | |---|||| |||||||| || 2439 TAGGTTTCCATTTAGGTTGTAAATGTAACCAACCTGC ********************************************************* Number 5 Local Alignment Similarity Score : 28 Match Percentage : 59% Number of Matches : 88 Number of Mismatches : 60 Total Length of Gaps : 0 Begins at (5131, 2653) and Ends at (5278, 2800) 0 . : . : . : . : . : 5131 CCAAACCACCTGGGCACTAGGCCCAATGTGAGTTGGATCACTTAGCCACG |||||:::| ||:||| | ||:|::|::|| : ||:|| : | |||:| 2653 CCAAATTGCATGAGCAATTGGTCTGACATGTAAAGGGTCTTGTCCCCATG 50 . : . : . : . : . : 5181 CTTCATAATTAGAAAAACGAGCACCGTGGAAATACATGCCGCTCAGCCAA ||||| ||||| : |:|||| ||||:|| | |:||: : ||| 2703 CTTCAAAATTACCTTGCCAAGCAACGTGAAATAAATTACCAGAAGTCCAT 100 . : . : . : . : . 5231 AGAAAGATGATGGAGAGTTGACCGAAATGTGCACTAAATACTTTTCGA |:|||:||||| | |:||||||:||||||| :||| |::|||:|| 2753 AAAAAAATGATTGCTAATTGACCAAAATGTGACGCAAAAATCTTTTGA ********************************************************* Number 6 Local Alignment Similarity Score : 18 Match Percentage : 72% Number of Matches : 29 Number of Mismatches : 11 Total Length of Gaps : 0 Begins at (5929, 5950) and Ends at (5968, 5989) 0 . : . : . : . : 5929 TAGTTTTAATAATAAGAATTTTGTTTAATTTAATATAATA ||| | ||||| ||:|| ||:||||| |||||:|||| 5950 TAGAGTAAATAAAAAAAAGGTTATTTAAAATAATACAATA ********************************************************* Number 7 Local Alignment Similarity Score : 17.6 Match Percentage : 60% Number of Matches : 42 Number of Mismatches : 16 Total Length of Gaps : 12 Begins at (2981, 918) and Ends at (3050, 975) 0 . : . : . : . : . : 2981 AATTTCCTTGCCAAGCTACATGAAACAGATTTCCGGAAGTCCACAGAAAA ||| ||| :|||| | ||: |||||| | |||:| ||:||| |----- 918 AATATCCACGCCACGATATCAGAAACATAAATCCAGTAGCCCAAA 50 . : . : 3031 ATTATTGCTAATTGACCAAA -------|||| |||||||| 963 CTAAATGACCAAA ********************************************************* Number 8 Local Alignment Similarity Score : 17 Match Percentage : 71% Number of Matches : 28 Number of Mismatches : 11 Total Length of Gaps : 0 Begins at (4481, 3583) and Ends at (4519, 3621) 0 . : . : . : . 4481 TGACCTGTAAATGGACCTTTATGAGCTTCTAAAATATCT ||| :|||||||| |: ||||| | |||||| |||| 3583 TGAATTGTAAATGCATGAATATGATGTACTAAAAAATCT exit 0